Затем последовала головокружительная операция по переустройству Физико-технического института имени Иоффе, которым Алфёров не мог руководить после того, как отметил 75-летие. Что сделал Жорес Иванович? Он объединил Физтех, Научно-технический центр «Центр микроэлектроники и субмикронных гетероструктур» и Научно-образовательный комплекс с физико-техническим лицеем в единый холдинг, именуемый Санкт-Петербургский научным центром Российской Академии Наук. И сам стал его президентом, с возможностью занимать этот пост хоть до столетия! И всё бы ничего, работай алфёровские структуры как следует. Но ничего подобного не наблюдалось. Деньги государства и крупных корпораций осваивались бесперебойно, а заказы срывались один за другим. Министерство атомной промышленности так и не получило затребованной технологию выращивания структур для светодиодов, а «Норильскому никелю» вместо новейших разработок всучили материалы десятилетней давности. Попилом и освоением государственных денег бизнес Алфёрова не ограничивается, сверх того он получает доходы от множества действующих на территории холдинга фирм, пользующихся его оборудованием и откатывающим руководству положенному долю. Формально проверить этот мутный бизнес может Академия Наук, но академик Алфёров проверку самого себя устраивать, видимо, не собирается.