Отрицая финансирование своих кандидатов фондом "Открытая Россия" Михаила Ходорковского и угрожая нарушителям исключением, руководство партии "Яблоко" подчёркивает, что для него "совершенно неприемлемо влияние со стороны каких бы то ни было чуждых структур на наших членов партии и депутатов. Поэтому, полагают в партии, получение какой-либо материальной или организационной поддержки со стороны чуждых политических структур не совместимо с пребыванием в партии и её предвыборных списках". Между тем 5 ноября 2003 года лично основатель партии Григорий Явлинский признал, что "с арестом Ходорковского финансовая поддержка "Яблока" остановилась", то есть раньше она имела место.